Главной особенностью самолета Ил-96-300 с точки зрения его эксплуатационной технологичности по сравнению е Ил-86 остается наличие на самолета Ил-96-300 более совершенных и развитых систем встроенного контроля, обнаружения и распознавания неисправностей при техническом обслуживании. Эти системы собирают информацию о работе бортовых функциональных систем и оборудования (вплоть до работы отдельных составляющих элементов) самолета в рейсе, регистрируют ее и, в случае надобности, могут отпустить информацию об имевших место неисправностях либо на индикаторах электронно-лучевых трубок комплексной информационной система сигнализации, либо в виде распечаток. В результате значительно сокращается объем технического обслуживания самолета и повышается эффективность технического обслуживания.Как и на Ил-86, сравнительно небольшая стояночная высота самолета позволяет делать большую часть операций по обслуживанию самолета Ил-96-300 без высоких стремянок, а рациональное размещение бортовых точек обеспечивает одновременное подключение всех средств наземного обслуживания. Для обслуживания и подготовки самолета Ил-96-300 к полету используются в основном средства аэродромного обслуживания общего применения.